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Génotypage végétal - Outil de traçabilité et de sélection

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Les outils moléculaires sont de plus en plus utilisés par les professionnels dans le cadre de la sélection assistée par marqueurs. Sans remplacer l’expérimentation au champ, ils permettent de gagner un temps précieux dans la création variétale en facilitant le tri des descendants. 

Nos solutions analytiques

 Eurofins est un laboratoire leader en prestation de service de Marquage Moléculaire. Il met ces marqueurs au service de la filière semences pour de nombreuses applications telles que : 

  • l’élaboration d’empreintes génétiques pour les espèces de grande culture et les espèces potagères : caractérisation et identification variétale, constitution de bases de données, contrôle qualité,
  • le suivi d’hybridité : choix de lignées parentales divergentes, détection des autofécondations
  • la Sélection Assistée par Marqueurs (SAM). 

De nombreux marqueurs moléculaires existent et sont choisis en fonction de leurs caractéristiques, du matériel à analyser et des applications potentielles : 

• les marqueurs microsatellites ou SSR (Single-Sequence Repeat) qui correspondent à des régions non codantes du génome présentant un motif d’ADN répété de type (CA)n. Ce sont des marqueurs codominants et très polymorphes nécessitant un effort de développement pour chaque espèce végétale. Actuellement, plus de 1000 marqueurs microsatellites sont disponibles au laboratoire pour une quarantaine d’espèces. 

• les marqueurs AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) qui sont obtenus par restriction enzymatique de l’ADN total et amplification sélective de certains fragments. Ils sont très polymorphes et permettent de travailler sur tout matériel végétal sans connaissance préalable du génome. 

Analyses associées 

Dans le laboratoire d’Eurofins à Nantes, le génotypage par marqueurs SSR s’organise autour de l’électrophorèse multicapillaire, technologie très sensible et très fiable. Ce pôle expert propose également l’utilisation d’autres marqueurs tels que les AFLP, RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) ou SNP (Single Nucleotide Polymorphism) pour la réalisation de tests de routine, et aussi la gestion de projets « à façon ». 

Nos services complémentaires :

  • Prélèvement d'échantillons sur le site, en conformité avec les normes nationales/internationales
  • Contrôle de vos eaux de process, eaux chaudes sanitaires, eaux des TAR et eaux de rejet
  • Conseil et Audits concernant vos problématiques de contrôle qualité (dans vos usines et sur les sites de vos fournisseurs)
  • Formation de vos équipes sur les questions liées au contrôle qualité, l'hygiène et l'HACCP
  • Evaluation sensorielle et conseil en développement produit : tests hédoniques faisant appel à des panels de consommateurs, études qualitatives, études marketing, …

Les + Eurofins :

  • Des conseillers experts ayant une connaissance approfondie de la méthode, disponibles et à votre écoute
  • Des analyses accréditées* 
  • Un portefeuille d'analyses large pour toutes vos matières premières et produits finis
  • Un service client qui assure au quotidien le suivi personnalisé de vos échantillons
  • Un accès en ligne à vos échantillons et la possibilité de télécharger vos résultats via la plateforme EOL (Eurofins OnLine)
  • Un outil de veille en sécurité alimentaire, Vigial®
  • Engagement au sein de programmes de recherche nationaux et internationaux

* Portée d'accréditation sur www.cofrac.fr

 

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