Génotypage végétal par marqueurs moléculaires

Eurofins est un laboratoire leader en prestation de service de Marquage Moléculaire. Il met ces marqueurs au service de la filière semences pour de nombreuses applications telles que l’élaboration d’empreintes génétiques pour les espèces de grande culture et les espèces potagères (caractérisation de variétés, constitution de bases de données), le suivi d’hybridité (choix de lignées parentales divergentes) ou la sélection assistée par marqueurs.

De nombreux marqueurs moléculaires existent et sont choisis en fonction de leurs caractéristiques, du matériel à analyser et des applications potentielles.

Parmi ces marqueurs on trouve principalement :

• les marqueurs microsatellites ou SSR (Single-Sequence Repeat) qui correspondent à des régions non codantes du génome présentant un motif d’ADN répété de type (CA)n. Ce sont des marqueurs codominants et très polymorphes nécessitant un effort de développement ;

• les marqueurs AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) qui sont obtenus par restriction enzymatique de l’ADN total et amplifi cation sélective de certains fragments. Ils sont très polymorphes et permettent de travailler sur tout matériel sans connaissance de la séquence.

Dans le laboratoire de Nantes, le génotypage par marqueurs SSR s’organise autour de l’électrophorèse multicapillaire, technologie très sensible et très fiable. Ce pôle expert propose également l’utilisation d’autres marqueurs tels que les AFLP, RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) ou SNP (Single Nucleotide Polymorphism) pour la réalisation de tests de routine, et aussi la gestion de projets « à façon ».